Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HINFPQ9BQA5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms