Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ90

KLHDC3, Kelch domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC3Q9BQ90 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHDC3Q9BQ90 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms