Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3GL2Q99962 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms