Protein–RNA interactions for Protein: Q99943

AGPAT1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT1Q99943 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGPAT1Q99943 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
AGPAT1Q99943 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGPAT1Q99943 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGPAT1Q99943 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGPAT1Q99943 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGPAT1Q99943 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGPAT1Q99943 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGPAT1Q99943 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGPAT1Q99943 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGPAT1Q99943 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGPAT1Q99943 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGPAT1Q99943 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGPAT1Q99943 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGPAT1Q99943 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGPAT1Q99943 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
AGPAT1Q99943 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
AGPAT1Q99943 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGPAT1Q99943 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
AGPAT1Q99943 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGPAT1Q99943 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGPAT1Q99943 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGPAT1Q99943 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGPAT1Q99943 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGPAT1Q99943 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGPAT1Q99943 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGPAT1Q99943 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGPAT1Q99943 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms