Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHP1Q99653 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHP1Q99653 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms