Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MMP19Q99542 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
MMP19Q99542 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms