Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SORT1Q99523 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms