Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
YME1L1Q96TA2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YME1L1Q96TA2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YME1L1Q96TA2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YME1L1Q96TA2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YME1L1Q96TA2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YME1L1Q96TA2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
YME1L1Q96TA2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms