Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK5RAP2Q96SN8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDK5RAP2Q96SN8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDK5RAP2Q96SN8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms