Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMG1Q96Q15 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms