Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GBP4Q96PP9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.4 ms