Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms