Protein–RNA interactions for Protein: Q96L42

KCNH8, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH8Q96L42 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
KCNH8Q96L42 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
KCNH8Q96L42 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
KCNH8Q96L42 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
KCNH8Q96L42 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
KCNH8Q96L42 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
KCNH8Q96L42 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
KCNH8Q96L42 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
KCNH8Q96L42 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
KCNH8Q96L42 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
KCNH8Q96L42 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
KCNH8Q96L42 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
KCNH8Q96L42 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
KCNH8Q96L42 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
KCNH8Q96L42 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
KCNH8Q96L42 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
KCNH8Q96L42 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
KCNH8Q96L42 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
KCNH8Q96L42 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
KCNH8Q96L42 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC36.2■■■■□ 3.39
KCNH8Q96L42 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
KCNH8Q96L42 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
KCNH8Q96L42 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC36.11■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC36.1■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC36.09■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
KCNH8Q96L42 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms