Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK5RAP3Q96JB5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK5RAP3Q96JB5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK5RAP3Q96JB5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK5RAP3Q96JB5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK5RAP3Q96JB5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK5RAP3Q96JB5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK5RAP3Q96JB5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK5RAP3Q96JB5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK5RAP3Q96JB5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK5RAP3Q96JB5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK5RAP3Q96JB5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK5RAP3Q96JB5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK5RAP3Q96JB5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK5RAP3Q96JB5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK5RAP3Q96JB5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK5RAP3Q96JB5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK5RAP3Q96JB5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK5RAP3Q96JB5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK5RAP3Q96JB5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK5RAP3Q96JB5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK5RAP3Q96JB5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK5RAP3Q96JB5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK5RAP3Q96JB5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK5RAP3Q96JB5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK5RAP3Q96JB5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK5RAP3Q96JB5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK5RAP3Q96JB5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK5RAP3Q96JB5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK5RAP3Q96JB5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms