Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZC2HC1AQ96GY0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZC2HC1AQ96GY0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms