Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCMH1Q96GD3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCMH1Q96GD3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCMH1Q96GD3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCMH1Q96GD3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCMH1Q96GD3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCMH1Q96GD3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SCMH1Q96GD3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCMH1Q96GD3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCMH1Q96GD3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms