Protein–RNA interactions for Protein: Q96G23

CERS2, Ceramide synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS2Q96G23 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CERS2Q96G23 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CERS2Q96G23 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms