Protein–RNA interactions for Protein: Q96F44

TRIM11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM11Q96F44 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM11Q96F44 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM11Q96F44 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM11Q96F44 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM11Q96F44 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM11Q96F44 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM11Q96F44 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM11Q96F44 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM11Q96F44 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM11Q96F44 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM11Q96F44 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM11Q96F44 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM11Q96F44 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM11Q96F44 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM11Q96F44 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM11Q96F44 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM11Q96F44 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM11Q96F44 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM11Q96F44 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM11Q96F44 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM11Q96F44 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM11Q96F44 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM11Q96F44 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM11Q96F44 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM11Q96F44 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms