Protein–RNA interactions for Protein: Q96EK2

PHF21B, PHD finger protein 21B, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21BQ96EK2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms