Protein–RNA interactions for Protein: Q96D71

REPS1, RalBP1-associated Eps domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPS1Q96D71 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
REPS1Q96D71 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REPS1Q96D71 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REPS1Q96D71 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms