Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDF1Q96CC6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms