Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VOPP1Q96AW1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms