Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 COTL1-202ENST00000561707 781 ntTSL 1 (best)12.73□□□□□ -0.371e-9■■■■■ 75.7
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TBRG4Q969Z0 LGALS9-205ENST00000467111 1512 ntTSL 212.45□□□□□ -0.421e-9■■■■■ 75.7
TBRG4Q969Z0 LGALS9-203ENST00000395473 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.51e-9■■■■■ 75.7
TBRG4Q969Z0 PAH-210ENST00000550978 652 ntTSL 22.84□□□□□ -1.951e-9■■■■■ 75.7
TBRG4Q969Z0 PAH-217ENST00000635500 189 ntTSL 30.49□□□□□ -2.331e-9■■■■■ 75.7
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TBRG4Q969Z0 PACSIN2-209ENST00000453079 505 ntTSL 24.8□□□□□ -1.641e-6■■■■■ 75.6
TBRG4Q969Z0 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 75.2
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TBRG4Q969Z0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.262e-6■■■■■ 74.8
TBRG4Q969Z0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.112e-6■■■■■ 74.8
TBRG4Q969Z0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 74.8
TBRG4Q969Z0 AKT1-215ENST00000555926 553 ntTSL 318.84■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 74.8
TBRG4Q969Z0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 74.8
TBRG4Q969Z0 AKT1-208ENST00000554581 3916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 74.8
TBRG4Q969Z0 AKT1-202ENST00000402615 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 74.8
TBRG4Q969Z0 PTPRK-219ENST00000531050 2515 ntTSL 1 (best)7.74□□□□□ -1.171e-6■■■■■ 74.8
TBRG4Q969Z0 SRRM2-222ENST00000575009 1146 ntTSL 525.58■■□□□ 1.692e-8■■■■■ 74.5
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TBRG4Q969Z0 SRRM2-223ENST00000575701 860 ntTSL 324.87■■□□□ 1.572e-8■■■■■ 74.5
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TBRG4Q969Z0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.552e-8■■■■■ 74.5
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TBRG4Q969Z0 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.065e-7■■■■■ 74.5
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TBRG4Q969Z0 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.057e-7■■■■■ 74.5
TBRG4Q969Z0 SRRM2-208ENST00000571378 2870 ntTSL 1 (best)14.63□□□□□ -0.072e-8■■■■■ 74.5
TBRG4Q969Z0 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.129e-7■■■■■ 74.5
TBRG4Q969Z0 STK11-203ENST00000585748 746 ntTSL 313.67□□□□□ -0.222e-16■■■■■ 74.5
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TBRG4Q969Z0 OSBPL3-206ENST00000409555 3088 ntTSL 58.39□□□□□ -1.075e-7■■■■■ 74.5
TBRG4Q969Z0 TAF4-207ENST00000608887 284 ntTSL 48.71□□□□□ -1.026e-7■■■■■ 74.4
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TBRG4Q969Z0 TCF20-202ENST00000359486 7410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.89e-9■■■■■ 73.2
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TBRG4Q969Z0 AC008764.4-205ENST00000593459 222 ntAPPRIS P1 TSL 37.89□□□□□ -1.157e-8■■■■■ 73.2
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TBRG4Q969Z0 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.357e-8■■■■■ 73.2
TBRG4Q969Z0 AC008764.4-203ENST00000593991 548 ntTSL 25.06□□□□□ -1.67e-8■■■■■ 73.2
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TBRG4Q969Z0 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 72.7
TBRG4Q969Z0 RNGTT-201ENST00000369475 1725 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.661e-6■■■■■ 72.7
TBRG4Q969Z0 RNGTT-203ENST00000538899 1374 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.311e-6■■■■■ 72.7
TBRG4Q969Z0 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.772e-76■■■■■ 72.6
TBRG4Q969Z0 ELK4-204ENST00000616704 2535 ntTSL 225.09■■□□□ 1.611e-9■■■■■ 72.6
TBRG4Q969Z0 TRAPPC9-215ENST00000524162 591 ntTSL 420.49■□□□□ 0.875e-7■■■■■ 72.6
TBRG4Q969Z0 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.011e-9■■■■■ 72.6
TBRG4Q969Z0 TRAPPC9-213ENST00000522504 665 ntTSL 314.71□□□□□ -0.055e-7■■■■■ 72.6
TBRG4Q969Z0 TRAPPC9-206ENST00000519482 551 ntTSL 412.05□□□□□ -0.485e-7■■■■■ 72.6
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TBRG4Q969Z0 SERGEF-220ENST00000532389 833 ntTSL 520.48■□□□□ 0.872e-11■■■■■ 71.9
TBRG4Q969Z0 TRAPPC9-214ENST00000523777 705 ntTSL 316■□□□□ 0.153e-7■■■■■ 71.9
TBRG4Q969Z0 SERGEF-203ENST00000524716 548 ntTSL 49.82□□□□□ -0.842e-11■■■■■ 71.9
TBRG4Q969Z0 AC055860.1-201ENST00000525523 688 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.282e-11■■■■■ 71.9
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TBRG4Q969Z0 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.227e-7■■■■■ 71.7
TBRG4Q969Z0 NUMA1-202ENST00000358965 7227 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.457e-7■■■■■ 71.7
TBRG4Q969Z0 NUMA1-201ENST00000351960 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.877e-7■■■■■ 71.7
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