Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOP1MTQ969P6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms