Protein–RNA interactions for Protein: Q92832

NELL1, Protein kinase C-binding protein NELL1, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL1Q92832 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NELL1Q92832 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NELL1Q92832 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELL1Q92832 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms