Protein–RNA interactions for Protein: Q92560

BAP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BAP1Q92560 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BAP1Q92560 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BAP1Q92560 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms