Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HERVK_113Q902F9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HERVK_113Q902F9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms