Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL1Q8WXF7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms