Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM8

SCFD1, Sec1 family domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCFD1Q8WVM8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCFD1Q8WVM8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SCFD1Q8WVM8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.1 ms