Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU2

SSC4D, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4DQ8WTU2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SSC4DQ8WTU2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SSC4DQ8WTU2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms