Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX29Q8TEQ0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms