Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
DDX54Q8TDD1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
DDX54Q8TDD1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
DDX54Q8TDD1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
DDX54Q8TDD1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
DDX54Q8TDD1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
DDX54Q8TDD1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
DDX54Q8TDD1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
DDX54Q8TDD1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
DDX54Q8TDD1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DDX54Q8TDD1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
DDX54Q8TDD1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
DDX54Q8TDD1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
DDX54Q8TDD1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
DDX54Q8TDD1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
DDX54Q8TDD1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
DDX54Q8TDD1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
DDX54Q8TDD1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
DDX54Q8TDD1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms