Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CNIH3Q8TBE1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CNIH3Q8TBE1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CNIH3Q8TBE1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNIH3Q8TBE1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNIH3Q8TBE1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNIH3Q8TBE1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNIH3Q8TBE1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNIH3Q8TBE1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNIH3Q8TBE1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNIH3Q8TBE1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNIH3Q8TBE1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CNIH3Q8TBE1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CNIH3Q8TBE1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNIH3Q8TBE1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNIH3Q8TBE1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CNIH3Q8TBE1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNIH3Q8TBE1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNIH3Q8TBE1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNIH3Q8TBE1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNIH3Q8TBE1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNIH3Q8TBE1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CNIH3Q8TBE1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CNIH3Q8TBE1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CNIH3Q8TBE1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNIH3Q8TBE1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CNIH3Q8TBE1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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