Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MYRIPQ8NFW9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYRIPQ8NFW9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms