Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPTSSBQ8NFR3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SPTSSBQ8NFR3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPTSSBQ8NFR3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPTSSBQ8NFR3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SPTSSBQ8NFR3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SPTSSBQ8NFR3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SPTSSBQ8NFR3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SPTSSBQ8NFR3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SPTSSBQ8NFR3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SPTSSBQ8NFR3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPTSSBQ8NFR3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms