Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE63

HIPK4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK4Q8NE63 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIPK4Q8NE63 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms