Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z9

LMNTD1, Lamin tail domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD1Q8N9Z9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMNTD1Q8N9Z9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms