Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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RNF148Q8N7C7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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RNF148Q8N7C7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF148Q8N7C7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
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