Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J5

PPM1K, Protein phosphatase 1K, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1KQ8N3J5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPM1KQ8N3J5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPM1KQ8N3J5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PPM1KQ8N3J5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPM1KQ8N3J5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPM1KQ8N3J5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPM1KQ8N3J5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPM1KQ8N3J5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPM1KQ8N3J5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPM1KQ8N3J5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPM1KQ8N3J5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPM1KQ8N3J5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPM1KQ8N3J5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPM1KQ8N3J5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms