Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC43Q8N309 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC43Q8N309 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms