Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GPC2Q8N158 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms