Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVD9

NUDCD3, NudC domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD3Q8IVD9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUDCD3Q8IVD9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms