Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV76

PASD1, Circadian clock protein PASD1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PASD1Q8IV76 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PASD1Q8IV76 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PASD1Q8IV76 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PASD1Q8IV76 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PASD1Q8IV76 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PASD1Q8IV76 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PASD1Q8IV76 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PASD1Q8IV76 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PASD1Q8IV76 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PASD1Q8IV76 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PASD1Q8IV76 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PASD1Q8IV76 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PASD1Q8IV76 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms