Protein–RNA interactions for Protein: Q86YI8

PHF13, PHD finger protein 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF13Q86YI8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF13Q86YI8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF13Q86YI8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF13Q86YI8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF13Q86YI8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF13Q86YI8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF13Q86YI8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF13Q86YI8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF13Q86YI8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF13Q86YI8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF13Q86YI8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF13Q86YI8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF13Q86YI8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF13Q86YI8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF13Q86YI8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF13Q86YI8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF13Q86YI8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF13Q86YI8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF13Q86YI8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHF13Q86YI8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF13Q86YI8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms