Protein–RNA interactions for Protein: Q86WP2

GPBP1, Vasculin, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1Q86WP2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPBP1Q86WP2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPBP1Q86WP2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GPBP1Q86WP2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GPBP1Q86WP2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GPBP1Q86WP2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GPBP1Q86WP2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPBP1Q86WP2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPBP1Q86WP2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPBP1Q86WP2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms