Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4K8

TRIM46, Tripartite motif-containing protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM46Q7Z4K8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM46Q7Z4K8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms