Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APTXQ7Z2E3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms