Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSX7Q7RTT5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms