Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP9Q7RTR0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms