Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HS2ST1Q7LGA3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms